Avant la réalisation des images, il est nécessaire de distendre le rectum par la mise en place de gel hydrique, grâce à la mise en place d'une petite canule rectale.
La déféco-IRM se déroule ensuite comme toute les autres exploration IRM : allongé sur une table d'examen à l'intérieur d'un tunnel avec une antenne placée au niveau de la zone d'exploration.
Lors de la première partie de l’examen, il vous sera demandé une immobilité totale, puis lors de la phase dynamique, il vous faudra réaliser dans l'ordre : une contraction, des poussées sans évacuation du gel puis une ou plusieurs poussée avec évacuation. Des protections seront mises en place au préalable afin d'optimiser le confort de l'examen.
L'examen est généralement indolore.