L'entéro-IRM se déroule comme toute les autres exploration IRM : allongé sur une table d'examen à l'intérieur d'un tunnel avec une antenne placée au niveau de la zone d'exploration. Pour bien étudier l’intestin grêle et ses parois, le radiologue a besoin que celui-ci soit distendu. C’est pour cette raison que l’on remplit l’intestin grêle de liquide. Celui-ci sera administré par voie orale (une solution de produit que vous devrez boire, à raison de plusieurs millilitres tous les quarts d’heure). Ce liquide n'est pas absorbé par l’intestin, il reste ainsi dans la lumière digestive rendant visibles les pathologies inflammatoires.
Vous serez ensuite perfusé pour permettre l’injection intra-veineuse de produit de contraste.
Vous devrez suivre attentivement les indications qui vous seront données : votre coopération est essentielle pour que les images ne soient pas floues. Il vous sera ainsi demandé de ne pas bouger et parfois d’arrêter de respirer quelques secondes.
En dehors de l'éventuelle mise en place de la voie veineuse, cet examen est totalement indolore.